標準的な薬物療法、手術療法にて眼圧下降が得られない難治性緑内障(血管新生緑内障、手術を何度行っても眼圧下降しない緑内障、絶対緑内障など)の場合、毛様体冷凍凝固術が適応となることがあります。

手技は局所麻酔を行ったのちプローブという器具を使い－80℃ 約60秒間、毛様体(角膜輪部から3～4 mm離れた部位)を冷凍凝固していきます。
毛様体は房水 (眼内の水分)を産生する部位であり、その房水産生量は眼圧を決定する因子のひとつです。そこを冷凍凝固にて破壊する事により房水産生を減らし、眼圧を下降させるのです。

この手術は時に術後の炎症が強いことがあり、消炎鎮痛薬の投与や副腎皮質ステロイドの投与を行います。また合併症として虹彩毛様体炎、一過性眼圧上昇、前房などへの出血、白内障、さらに非常に稀ですが眼球癆 (眼が小さく萎縮してしまう) があります。
眼圧下降が得られない場合は眼の状態が安定してから再度毛様体冷凍凝固を行う場合があります。理論的には眼圧が下がらなければ何度でも行える手術です。